8. prosinec 1989
Ministr školství Milan Adam pozastavil na univerzitách činnost ústavů marxismu-leninismu na vysokých školách, a k 31. prosinci 1989 je úplně zrušil. Od poloviny prosince se také postupně rozpadaly fakultní organizace KSČ, na Lékařské nebo Pedagogické fakultě se tak stalo už začátkem prosince.

20. prosinec 1989
V biologické posluchárně Lékařské fakulty se volil první „polistopadový“ rektor Masarykovy univerzity. Dvě stě sedm hlasujících nakonec z kandidátů, které nominovali zástupci akademických občanských fór a fakultních stávkových výborů, vybralo Milana Jelínka.

6. leden 1990
Vychází ministerské pokyny upravující postup při rehabilitacích studentů a zaměstnanců škol a školských zařízení. Už od listopadu 1989 se ozývalo stále více hlasů, které žádaly odčinění křivd spáchaných na učitelích a studentech v průběhu více než čtyřiceti let komunistické nadvlády. Na Masarykově univerzitě působilo celkem šest rehabilitačních komisí, zasedali v nich zástupci učitelů, studentů i Občanského fóra a politicky diskriminovaných pracovníků brněnských vysokých škol. Rehabilitace učitelů, kteří museli z politických důvodů opustit svá místa, zahrnovala i možnost návratu na univerzitu. Mezi nápravná opatření patřilo také udělování vědeckých hodností nebo úprava pracovního zařazení, některým vyloučeným studentům bylo umožněno dostudovat. Součástí rehabilitačního procesu byl i postih osob, které se v uplynulých letech hrubě provinily proti etice vysokoškolského učitele. Tito lidé museli univerzitu opustit.

22. leden 1990
Tímto dnem byly zrušeny Útvary kádrové a personální práce, které platily po celou dobu své existence za nástroj politické diskriminační činnosti na univerzitě.

31. leden 1990
Pro vědeckou sterilitu končí činnost katedry branné a mimoškolní výchovy a pedagogické praxe. K 30. červnu byla rozpuštěna vojenská katedra, jejíž poslání na univerzitě rovněž skončilo.

17. únor 1990
Na vedení Masarykovy univerzity se obrátil Spolek farmaceutů v Brně s žádostí o znovuzřízení farmaceutické fakulty, která byla zrušena v roce 1960. Fakulta dokonce získala akreditaci ministerstva školství, nakonec vznikla v rámci Veterinární a farmaceutické univerzity.

27. únor 1990
Parlament na svém zasedání přijal zákon, kterým se změnil název z Univerzity Jana Evangelisty Purkyně na Masarykovu univerzitu.

10. duben 1990
Akademická rada univerzity schválila návrh na zřízení Ekonomicko-správní fakulty. Ta vznikla coby šestá a první „polistopadová“ fakulta univerzity 1. ledna 1991.

Zdroj: Urbášek, Pavel – Pulec, Jiří a kol.:
Kapitoly z dějin univerzitního školství
na Moravě v letech 1945–1990